在反渗透装置运行中，有很多因素会影响反渗透装置运行，反渗透装置的产水量和脱盐率也是反渗透装置运行中的关键参数，反渗透装置的产水量和脱盐率会受到以下几个因素的影响。
（1）压力
随着反渗透装置的进水压力升高导致膜的水通量增大，反渗透装置的压力增加，响盐透过量不变。进水流量增加时，水中的盐量下降，反渗透装置的脱盐率就提高了。
（2）温度
温度是反渗透装置运行过程中的重要因素之一，会对反渗透装置的脱盐率、以及压力和压降产生影响。随着温度的上升，反渗透膜的渗透滤增加，在一定进水流量下要推动力降低，反渗透装置的压力也会降低。同时原水的流通速度也会随温度的升高增加，对于反渗透装置来说，一般原水的温度升高或降低，都会对反渗透设备的产水量造成2-4%的损失，所以冬天的时候，我们反渗透设备的运行操作压力要增高，保证设备的产水。
（3）回收率
回收率 对每个阶段 的压降 都有很大影响 。在保持进水总流量不变的情况下 ，回收率增加 。由于反渗透设备的高压侧浓水流量变少 ，总压变低 ，回收变少 ，总压降增加 。根据实际操作情况来件 ，即使回收率变化很小 ，如百分之一，总压差 也会发生 0.02MPa左右 的变化
。回收率对产品水电导率的影响取决于盐透过量和产品水量，一般说来，系统回收率增大，会增加浓水中的含盐量，并相应增加产品水的电导率。
（4）进水含盐量
对反渗透装置来说，进水的含盐碱不同，在运行过程中的压力和电导率都会存在差异。
（5）pH值
膜组件对PH值有一定要求，反渗透膜的PH值会对水质电导产生一定影响。